illustrate:一款蛋白/核酸结构快速渲染为“卡通风格”的小工具
本期向大家介绍一款蛋白/核酸结构快速渲染(卡通风格)的小工具——illustrate。放心!本期完全不涉及代码,不折腾人,请放心食用。
结构渲染效果示例如下:
PDB ID: 1ttt
该小工具适用绘制蛋白或复合物整体轮廓,但不适合用来绘制残基侧链的相互作用。illustrate绘制的风格是我本人非常喜欢的“卡通风”。尽管Chimera也可以实现此功能,但毕竟还是要费些功夫的。illustrate则可以一键出图,丝滑~。
操作视频
网站地址:
https://ccsb.scripps.edu/illustrate/
3月22日
操作流程(文字版)
-
1. 前往https://ccsb.scripps.edu/illustrate/网站,滑动到页面最下方:
- 2. 你可以选择点击
选择文件
按钮上传pdb文件,也可以直接输入pdb id直接调用数据库中的结构。这里我选择了直接输入pdb id为1ttt的结构。输入之后稍等片刻右侧视图框会出现蛋白图像。 -
3. 调整蛋白朝向。
-
• 旋转:拖动鼠标左键;
-
• 放大/缩小:滑动鼠标滚轮
-
• 移动位置:ctrl+拖动鼠标左键
-
4. 点击按键
illustrate
绘制
根据绘制的蛋白大小需要等待的时间也长短不一,耐心等一会儿。
5. 保存图片到本地
点击最右侧渲染出的图片会跳转新的网页,右键保存到本地。